2006年9月12日，由广州市天河区建设和市政局与华南植物园共同投资的兴科路（华南植物园西门至广东省生态与土壤研究所东门路段）部分路段改造工程正式开工。12日上午，天河区建设和市政局、华南植物园共建指挥部、合作部、资产部的相关工作人员，及该工程设计、施工、监理单位代表到现场协商道路改造工作。确定从华南植物园新西门起约200米路段率先开工，并于今年国庆节前完工，其余路段则将于国庆节后开工。
    多年来，广州化学研究所途经华南植物园西门至广东省生态与土壤研究所东门路段（现名兴科路）路面损坏严重，道路排水严重堵塞，污水随地漫排，是华南植物园及附近居民出行的“老大难”问题。为彻底整治兴科路，经华南植物园领导并共建指挥部领导多次与广州市、天河区有关部门进行协商沟通后，确定由天河区建设和市政局与我园共同投资改造该路段，并配合院省市三方共建工作，积极推进工程进度，拟定于短期内完成整治工作。此次整治后，华南植物园将正式启用新建的西门及西门前的大型露天停车场，使华南植物园西门成为继正门后游客进出园区的第二通道。此举既缓解了游客和车辆对广汕公路造成的交通压力，又解决游客停车难问题，还大大改善了兴科路的交通状况，为华南植物园职工及附近居民出行提供了便利条件。