2006年7月4日，中科院陈竺副院长视察了华南植物园，这是院省市三方共建以来，陈竺副院长第7次到华南植物园检查指导工作。陈竺副院长一行听取了院省市三方共建项目的进展情况汇报、科研教育工作以及创新三期的重要领域部署情况的汇报，视察了共建项目的水系喷泉、游客中心及停车场、大型观光温室、城市景观生态园、澳大利亚植物园、能源植物园、广州第一村暨地带性植被园等共建项目现场，参观了园史展览馆和科研园区。陈竺副院长就华南植物园的共建、建园、人才、科研等工作作了重要指示。
　　首先，陈竺副院长充分肯定了华南植物园共建工作所取得的成效，认为通过三年的建设,华南植物园在硬件建设和文化建设方面取得了跨越式发展，园区面貌在原有基础上发生了很大变化，而且各个项目越做越好，越做越精致，建园过程充分体现了“科学内涵、艺术外貌、文化底蕴”的理念和“山清水秀、鸟语花香、峰回路转”的岭南园林特色，是高水平的。第一村项目、园史展览馆、科普信息中心，堪称是人与自然和谐发展的典范；温室项目博采众长，设计合理；水系既是景观同时又达到了给排水、排污目标。通过大共建拉动小共建，既解决了制约园发展的问题，也解决了历史遗留问题。华南植物园令人震憾的变化倾注了植物园人的心血，倾注了路院长和院党组的心血，倾注了省市领导的心血，这是思想认识统一、工作机制健全、组织管理有效、各方协调有序的结果，是一贯重视文化建设的成效，也是在前辈原有事业上的延续。华南植物园是中国植物园事业发展的缩影之一，是最具代表性的植物园，也是国际知名的综合性植物园。
　　陈竺副院长强调，在一期共建工作即将结束时，华南植物园要一边建设，一边总结，同时做好中长期建设规划。下一步不是规模的无限扩大，而是要在搭建好的硬件平台上做好软件方面的建设；要注重保护；注重与当地社会经济发展和科普旅游等有机结合；节约成本，做到可持续发展；加强国际交流与合作，进一步提升自身创新能力；树立高远的目标，创造更多的优势特色，尤其是人文特色，可将“广州第一村”等文化底蕴丰厚的项目建成我国人文与自然环境和谐的典范；在国家植物园的快速发展期，充分发挥华南植物园在国家植物园体系的引领、骨干和示范作用，要力争将华南植物园建设成为“东方的邱园”。
　　在人才队伍建设方面，陈竺副院长认为，经过二期创新的锤炼，华南植物园的科研队伍的自信心增强了，对自己的研究领域有了全局的把握，对学科的发展方向和工作意义有了深入的理解和分析。为了争取更高的目标，要将引进将帅之才与注重在开放的空间内自主培养现有人才相结合，从长远而言，更多的是培养人才，同时将培养的优秀人才留住用好。将帅之才进一步提高要在努力争取国家大项目的过程中提升自己。在园林园艺方面，可以利用植物园的学科和基地条件，通过所系强强联合的方式培养人才。为能更加充分体现华南植物园高水平的科学性和文化底蕴，建设一支科技含量高的园林园艺和科普导游队伍是非常必要的。
　　在科学研究方面，陈竺副院长肯定华南植物园的总体发展态势有了比较明显的上升，主要表现在争取科研资源能力的增强，科研产出的量与质的提高，人才队伍自信心的增强几个方面。高兴的是没有因院省市三方共建任务而削弱和影响科研工作。相反，科研工作更加注重系统性；更加注重用微观手段来解决宏观问题；科研论文更加注重质量，并与解决国家和地方需求相结合。下一步应该继续围绕生态学、系统演化和生物多样性保育、研究、利用三大优势学科而努力，在原有基础上更上层楼，同时注重在交叉和边缘学科上取得突破；要进一步加强生物学科技平台建设，积极争取国家重点实验室；进一步增强自信心，开展系统性的重大的原创性研究。陈竺副院长希望华南植物园科研人员要沉住气，静下心，专心致研。
　　中科院生物局学术秘书赵永仁，娄治平、邢雪荣处长，广州分院院长、华南植物园主任陈勇等陪同陈竺副院长视察。