针对2003年8月中科院监审局下发的《关于华南植物研究所财务审计的意见》中所提出的问题，华南植物园党政班子高度重视，多次召开专题会议，研究、部署和落实相关整改工作。会议决定由一名园领导专门负责，主抓有关整改工作的落实，制订工作计划，明确具体的经办人和督办人，认真对有关问题进行整改。
    在各部门的共同配合和群众的积极参与下，目前整改工作得到了较好地落实。基础工作逐步落实，各项规章制度已基本制订完成，部分在修改与完善之中；创新专项经费严格按要求进行了整改；课题管理、资产管理更加规范；基建管理和共建经费管理已按院省市三方认可的方式进行管理；清理和处置了一批历史上悬而未决的问题，除了一些比较复杂，一时还不能够整改到位的历史遗留问题外，目前整改工作已大部分完成，取得了阶段性成效。