11月17-19日，按照中科院对共建华南植物园项目验收工作的总体部署，由中科院基本建设局副局长邢淑英为组长、院生物局副局长苏荣辉和院计财局曹凝处长为副组长，以及来自院计划财务局、院办公厅、院基建局、北京植物所、昆明植物所、广州分院的专家组成的验收组，对共建华南植物园项目进行了初步验收。华南植物园主任黄宏文、副主任任海、魏平以及园相关部门参加了验收会议。
    17日下午，验收座谈会由邢淑英主持。她指出，此次三方共建植物园总投资3亿元人民币，共完成15个项目，经过了6年的规划、建设和改造，付出了巨大的努力，即将胜利在望，本次验收将分植物收集和保育、建安、财务、档案等4大块进行评估和验收。邢淑英还转达了院领导对华南植物园共建项目建设的肯定和期望。接着，任海同志做了《华南植物园共建项目整体情况介绍》的工作报告，从共建项目概述、项目建设及管理、建设结果及成效、存在的问题和领导关怀等5个方面进行了介绍和总结。随后，各块验收负责人分别对植物收集和保育、建安、财务、档案等共建项目4块工作进行了详细阐述。
    18日，验收组分为4个小组进行了现场评估和验收，财务小组审核了共建项目6年来的资金支出情况；档案小组查阅了100余卷基建档案；植物收集和保育小组、建安小组对大型展览温室群、地带性植被园暨广州第一村、华南珍稀濒危植物繁育中心、科普信息中心以及木兰园等专类园的建设情况进行现场考察，经过提问、答疑和座谈，验收组对华南植物园共建项目情况进行了深入了解，形成了初步验收意见。
    19日上午，验收会议由苏荣辉主持，验收组进行了集中讨论。随后，苏荣辉代表验收组宣读了共建工程验收意见，验收组认为华南植物园认真部署共建工程建设方案，从计划、报建到施工、植物配置、配套设施都逐一把关，完成了许多前期规划无法估计的困难，给予充分的肯定，同时专家组对于下一步工作提出了建设性意见。黄宏文表示，华南植物园将根据验收组的意见拿出整改措施，认真分析和逐步完善存在的不足，为今年12月的全面验收做好充分的准备工作。